长垣市的高等教育机构包括：
河南工学院长垣校区：
以工科为主的本科院校，位于长垣县东联镇。
河南理工大学长垣校区：
综合性大学，位于长垣县城南部的贾鲁河南岸。
河南牧业经济学院长垣校区：
擅长农业和畜牧业教学和科研，位于新屯镇。
豫南大学：
位于长垣县的高等院校之一。
河南师范大学新乡学院：
位于长垣县的高等院校之一。
新乡医学院长垣校区：
位于长垣县的高等院校之一。
河南科技学院长垣校区：
计划引进的本科院校之一。
长垣烹饪职业技术学院：
唯一的一所三年制专科学校，专注于烹饪专业。
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