新疆有多所本科大学，以下是一些主要的大学及其所在地：
新疆大学
所在地：乌鲁木齐
办学层次：本科
性质：公办
塔里木大学
所在地：阿拉尔
办学层次：本科
性质：公办
新疆农业大学
所在地：乌鲁木齐
办学层次：本科
性质：公办
石河子大学
所在地：石河子
办学层次：本科
性质：公办
新疆医科大学
所在地：乌鲁木齐
办学层次：本科
性质：公办
新疆师范大学
所在地：乌鲁木齐
办学层次：本科
性质：公办
喀什大学
所在地：喀什
办学层次：本科
性质：公办
新疆科技学院
所在地：巴音郭楞蒙古自治州
办学层次：本科
性质：公办
新疆理工学院
所在地：阿克苏地区
办学层次：本科
性质：公办
新疆和田学院
所在地：和田地区
办学层次：本科
性质：公办
新疆天山职业技术大学（克州校区）
所在地：克孜勒苏柯尔克孜自治州
办学层次：本科
性质：公办
新疆交通职业技术大学
所在地：乌鲁木齐市米东区
办学层次：本科
性质：公办
新疆工程学院
所在地：乌鲁木齐
办学层次：本科
性质：公办
新疆艺术学院
所在地：乌鲁木齐
办学层次：本科
性质：公办
昌吉学院
所在地：昌吉回族自治州
办学层次：本科
性质：公办
乌鲁木齐职业大学
所在地：乌鲁木齐
办学层次：本科
性质：公办
巴音郭楞职业技术学院
所在地：巴音郭楞蒙古自治州
办学层次：高职
性质：公办
阿克苏职业技术学院
所在地：阿克苏地区
办学层次：高职
性质：公办
新疆建设职业技术学院
所在地：乌鲁木齐市
办学层次：高职
性质：公办
伊犁师范大学
所在地：伊犁哈萨克自治州
办学层次：本科
性质：公办
新疆财经大学
所在地：乌鲁木齐
办学层次：本科
性质：公办
新疆政法学院
所在地：乌鲁木齐
办学层次：本科
性质：公办
新疆石河子职业技术学院
所在地：石河子市
办学层次：本科
性质：公办
石河子工程职业技术学院
所在地：石河子市
办学层次：高职
性质：公办
铁门关职业技术学院