南通职业大学有 启东校区和通州校区两个校区，每个校区都有其优势：
启东校区：
位于启东市，校园环境优美，交通便利，设施齐全，专业多样化。
通州校区：
位于通州区，离江苏省南通市区较近，交通便捷，学部设置较为完备，还有良好的实践场地和实验室。
因此，选择哪个校区主要取决于你的个人兴趣和专业设施需求。
此外，南通职业大学作为江苏省国家级示范性高职院校，办学实力和教学质量都非常优秀，专业齐全，师资队伍强大，学风正，管理严谨，学生就业广，而且就业率很高。
综合考虑，如果你更看重校园环境和交通便利性，可以选择启东校区；如果你更看重专业设置和实践设施，可以选择通州校区。