当前位于福建省莆田市的大学有两所，分别是：
莆田学院：
这是一所全日制普通本科院校，由福建省政府领导和管理，实行省市共建，以市为主的办学体制。莆田学院是教育部卓越医生教育培养计划实施高校，硕士学位授予单位，福建省A类一流应用型建设高校，福建省示范性应用型本科高校，并入选国家双万计划。
湄洲湾职业技术学院：
这是一所全日制公办高等职业院校，由福建化工学校、福建莆田华侨体育师范学校、莆田职业技术学校三所中专学校合并升格而成。
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