在县城上学的最佳大学选择如下：
西北农林科技大学
位置：陕西省咸阳市杨凌示范区
特点：唯一位于县城的985高校，首批入选“双一流”重点建设高校之一。全国农林水学科最为齐备的高等农业院校，有7个国家重点学科和2个国家重点（培育）学科，葡萄酒专业稳居全国第一。
石河子大学
位置：新疆石河子市
特点：中国最西端的211高校，拥有农学、农林经济管理、农业机械化及其自动化、临床医学、动物医学五个国家级特色专业。因其学校所在地偏僻，虽然为211高校，但录取分数线相对较低。
昆山杜克大学
位置：江苏苏州昆山
特点：由美国杜克大学和武汉大学合作创办的非营利性中美合办高校。学生顺利完成学业后可获得美国杜克大学学位及昆山杜克大学的学历与学位。含金量高，但学费也较高。
中国民用航空飞行学院
位置：四川德阳广汉
特点：直属中国民航局，全球办学规模最大、世界以飞行训练为主规模最大的飞行培训机构。被誉为“中国民航飞行员的摇篮”和“中国民航管理干部的黄埔军校”。
曲阜师范大学
位置：山东曲阜
特点：素有“考研神校”之称，考研率非常高。部分专业考研率能达到60%，一般维持在30%以上。学校名气虽高，但整体实力较其他高校稍逊一筹。
安徽科技学院
位置：安徽凤阳和蚌埠龙湖
特点：王牌专业为生物医学和动物医学，同时也是国家级重点建设学科。学校整体实力较前两校有所差距。
建议
西北农林科技大学和 石河子大学虽然位于县城，但都是国家重点支持的大学，具有很高的学术水平和研究实力，特别是西北农林科技大学在农业领域具有显著优势。
昆山杜克大学和 中国民用航空飞行学院虽然学费较高，但提供的教育资源和学位认可度非常高，适合有意向出国深造或从事民航事业的学生。
曲阜师范大学在考研方面表现优异，适合有志于继续深造的学生。
安徽科技学院和 山西农业大学虽然整体实力稍逊，但在某些特定领域如生物医学和动物医学方面具有优势，也值得考虑。
根据个人兴趣、职业规划及经济条件，可以选择最适合自己的大学。