秦州区位于中国甘肃省天水市，根据提供的信息，秦州区内的大学包括：
江苏秦州大学- 这是一个位于江苏省的大学，但具体信息不详。
南京大学金陵学院- 位于江苏省南京市浦口校区，是一所独立的三本学校。
南京中医药大学翰林学院- 位于秦州，是一所独立学院，后转变为南京中医药大学秦州区。
天水师院- 位于甘肃省天水市秦州区，是一所二本学校。
甘肃工业职业技术学院- 位于甘肃省天水市羲皇大道中路，是一所专科院校。
甘肃林业职业技术学院- 位于甘肃省天水市麦积区马跑泉路58号，也是一所专科院校。
兰州理工大学- 虽然没有明确指出位于秦州区，但曾在秦州区开展招生宣传活动，暗示着与秦州区有一定的联系。
陕西中医药大学- 位于陕西省，但具体是否在秦州区不详。
咸阳财经技术学院- 位于陕西省咸阳市，但具体是否在秦州区不详。
陕西财经职业技术学院- 位于陕西省，但具体是否在秦州区不详。
陕西科技大学镐京学院- 位于陕西省，但具体是否在秦州区不详。
咸阳职业技术学院- 位于陕西省咸阳市，但具体是否在秦州区不详。
请注意，上述信息可能不全面，且部分信息可能已经过时。建议直接咨询当地教育部门或相关院校获取最新信息