制药工程专业的毕业生在报考公务员时，可以关注以下岗位和部门：
医药监管部门：
包括药品监督管理局、食品药品监管、化妆品监管等职位。这些岗位与制药工程专业的生产、研发、安全等方面紧密相关，适合该专业的毕业生报考。
公共卫生医疗机构：
涉及药品采购、配送和使用管理等职责，制药工程专业的毕业生可以在此发挥专业知识和技能。
国有医药企业：
这些企业通常需要制药工程背景的人才来参与药品的生产和质量控制。
教师职位：
有些制药工程专业的毕业生可能会选择进入教育行业，担任与药学相关的教师职位。
市场监督管理局：
包括普通岗位和执法岗位，如药品监督管理、药检、卫生监督等。
发展和改革委员会 、 应急管理局、 科学技术协会、 生态环境保护综合行政执法支队、 乡镇机关等：这些部门也会招聘制药工程专业的人才，但具体岗位较少。
国家卫生健康委员会下属国家卫生计生委药具管理中心：
从事基本药物制度相关的政策建议、工作计划、报告、总结、项目文本等文字材料起草，参与基本药物监测评估等组织管理工作，需要本科及以上学历。
国家知识产权局下属专利局：
中药领域专利审查，需要硕士研究生及以上学历。
哈尔滨海关下属隶属海关：
从事海关检验检疫工作，需要本科及以上学历。
成都铁路公安局下属成都铁路公安局：
主要从事治安管理和化学物品分析及毒品检验等工作，需要本科及以上学历或硕士研究生以上。
在报考公务员时，建议制药工程专业的毕业生仔细查看最新的公务员招考简章，了解各个岗位的具体要求和报名条件，选择最适合自己的职位进行报考。同时，由于制药工程专业不属于药学类或中药学类，大部分岗位可能属于普通岗位，因此需要做好充分的准备和竞争准备。