上海市有以下日本大学：
东京大学：
在亚洲大学排名中名列前茅，专业设置全面，尤其在理学、医学、工学等领域具有很高的学术影响力。
京都大学：
日本排名第二的大学，有特殊的AAO制度协助招生。
大阪大学：
对学部入学EJU（留考）分数有明确的最低要求。
早稻田大学：
日本顶尖私立大学之一，以商科、文科、社会科学等领域见长。
庆应大学：
日本知名私立大学，以医学、商科、法学等领域著称。
此外，上海还有一些日本人学校，如上海日本人学校（浦东校区）、上海日本人外籍人员子女学校（虹桥校区），这些学校主要服务于在上海工作和定居的日本人子女，不招收中国学生。
建议：
东京大学、京都大学、大阪大学等顶尖学府在上海有较高的学术声誉和影响力，是留学的优选。
早稻田大学、庆应大学等私立大学在特定专业领域有优势，可以根据个人兴趣和职业规划进行选择。
上海日本人学校等日本人学校适合在日本在华家庭，特别是需要加深本土文化学习的子女。