南京拥有多所高等教育机构，其中包括一些国家重点建设的大学，即211和985工程院校。以下是南京的一些著名大学列表：
南京大学- 本科，公办，国家重点建设的一流大学之一，华东五校之一。
东南大学- 本科，公办，国家重点建设的一流大学之一，原985工程院校。
河海大学- 本科，公办，211工程院校。
南京理工大学- 本科，公办，211工程院校。
南京航空航天大学- 本科，公办，211工程院校，国防七校之一。
南京师范大学- 本科，公办。
中国药科大学- 本科，公办。
南京农业大学- 本科，公办，211工程院校。
南京邮电大学- 本科，公办。
南京工业大学- 本科，公办。
南京林业大学- 本科，公办。
南京信息工程大学- 本科，公办。
南京中医药大学- 本科，公办。
南京医科大学- 本科，公办。
南京艺术学院- 本科，公办。
南京体育学院- 本科，公办。
江苏警官学院- 本科，公办。
南京晓庄学院- 本科，公办。
金陵科技学院- 本科，公办。
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