云南省拥有一些知名的科研机构和高等教育机构，其中包括但不限于：
高等教育机构
云南大学
综合性大学，拥有多个研究生院专业。
化学、地球科学、生态学等13个学科上榜软科世界一流学科排名。
昆明理工大学
重点建设的综合性大学，拥有多个研究生院专业。
矿业工程、冶金工程等学科在全球有较高排名。
云南师范大学
师范类院校，拥有多个研究生院专业。
云南农业大学
农业类院校，拥有多个研究生院专业。
云南中医药大学
医学类院校，拥有多个研究生院专业。
西南林业大学
以林学、林业工程、风景园林学为传统优势，多学科门类协调发展。
云南财经大学
财经类院校，预计招生人数1667人。
云南民族大学
师范类院校，承担多项国家级和省级科研项目。
科研机构
云南省应用技术研究院
云南省机械研究设计院
云南师范大学太阳能研究所
云南省药物研究所
昆明贵金属研究所
昆明电器科学研究所
昆明冶金研究院
云南天文台
中国科学院昆明分院下属的昆明植物所、昆明动物所、版纳植物园、地球化学所
这些机构和大学在各自的领域进行着广泛的研究工作，并在国内外享有一定的声誉。云南大学作为云南省唯一的全国重点大学，在科研方面尤为突出，多个学科在软科世界一流学科排名中表现优异。