2001年全国各大学排名如下：
1. 清华大学
2. 浙江大学
3. 南京大学
4. 北京大学
5. 中国科学技术大学
6. 上海交通大学
7. 复旦大学
8. 哈尔滨工业大学
9. 天津大学
10. 南开大学
11. 武汉大学
12. 华中科技大学
13. 中国人民大学
14. 北京航空航天大学
15. 北京师范大学
16. 中山大学
17. 厦门大学
18. 大连理工大学
19. 四川大学
20. 同济大学
21. 北京理工大学
22. 东南大学
23. 西安交通大学
24. 天津大学
25. 吉林大学
26. 湖南大学
27. 大连海事大学
28. 西北工业大学
29. 重庆大学
30. 山东大学
31. 华东师范大学
32. 厦门大学
33. 哈尔滨工程大学
34. 华南理工大学
35. 天津医科大学
36. 中国农业大学
37. 南京理工大学
38. 东北师范大学
39. 对外经济贸易大学
40. 华东理工大学
41. 首都师范大学
42. 中南财经政法大学
43. 东北林业大学
44. 西南政法大学
45. 陕西师范大学
46. 大连医科大学
47. 南京航空航天大学
48. 湖南师范大学
49. 辽宁工程技术大学
50. 首都医科大学
以上排名综合了不同来源的数据，因此排名顺序和得分可能存在一定差异。建议参考多个排名来源以获得更全面的了解。