军事院校的专业主要分为两大类： 指挥类专业和非指挥类专业，以及“合训分流”专业。
指挥类专业：
这类专业有明确的培养目标，主要是为各军兵种培养军事指挥管理人才。毕业生将担任军事指挥军官，如排长、连长、营长等，以及政治指挥官、后勤指挥军官等。这类专业包括军事指挥、国防管理、军事后勤保障、军医学、武器系统与发射工程、特种作战、信息对抗等。
非指挥类专业：
这类专业主要为部队、军队科研单位和军校培养专业技术人才。毕业生主要到部队的各个专业技术岗位任职，根据工作岗位的具体需要，一般评任专业技术职务。这类专业包括信息工程、通信工程、系统工程专业、电子工程、计算机科学与技术等。
“合训分流”专业：
这是1999年全军院校编制体制调整后开始的新的初级指挥专业人才培养模式。这类专业在学历教育阶段进行合训，在专业训练阶段进行分流，旨在培养具有全面素质的初级指挥军官。
此外，军事院校还开设了一些与军事相关的交叉学科和特殊专业，如军事心理学、军事法律、军事外交、军事历史等。
建议选择军校专业时，应根据个人兴趣和职业规划来决定，同时要了解各个专业的培养目标和就业方向，以便更好地为未来的军事事业做准备。