截至2024年，南方科技大学共开设了 39个本科招生专业，涵盖理学、工学、医科教育，以及特色人文社会科学、商科与创意设计。具体专业设置如下：
理学
数学与应用数学
物理学
化学
生物学
统计学
数据科学与大数据技术
海洋科学
环境科学与工程
水文与水资源工程
生物信息学
工学
光电信息科学与工程
理论与应用力学
机械工程
微电子科学与工程
通信工程
信息工程
材料科学与工程
集成电路科学与工程
计算机科学与技术
智能科学与技术
航空航天工程
医科
生物医学工程
临床医学
生物技术
人文社会科学
人文社会科学学院开设的相关专业
商科
商学院开设的相关专业
创意设计
创新创意设计学院开设的相关专业
此外，学校还拥有7个博士学位授权一级学科点，9个硕士学位授权一级学科点，以及7个硕士专业学位授权点，实现了本硕博全系列的贯通培养。
建议学生在选择专业时，可以综合考虑自己的兴趣和职业规划，参考学校最新公布的专业设置和学科优势，选择最适合自己的发展方向。