晚清时期，中国的高等教育体系开始发生显著变化，出现了许多新式学堂和大学。以下是一些晚清时期的重要大学：
北洋水师学堂：
成立于1881年，是中国第一所海军学校，培养海军人才。
北洋武备学堂：
成立于1884年，是中国第一所军事学校，培养军事人才。
北洋大学堂：
成立于1895年，是中国第一所现代意义上的大学，后更名为北洋大学。
京师大学堂：
成立于1898年，是中国近代第一所国立大学，后成为北京大学。
广雅书院 （广州）、 两湖书院（武汉）、 自强学堂（武汉）和 南洋公学（上海）：被称为清末四大学府，是清末重要的教育机构。
江南大学堂（后改为国立东南大学）：是中国最早的民办大学之一。
圣约翰大学：
由西方传教士创办，是中国著名的教会大学之一。
光华大学：
以法学教育著称的民办大学。
上海交通大学：
其前身是1896年成立的南洋公学，是中国历史最悠久的高等学府之一。
武汉大学：
可以追溯到1893年湖广总督张之洞请清政府创办的自强学堂，后成为武汉大学。
这些大学在晚清至民国时期为中国培养了大量优秀人才，并对中国近代教育的发展产生了深远影响。