如东县境内有以下高等教育机构：
南京信息工程大学如东学院：
以信息工程、计算机科学与技术等为主要学科。
南通大学科学技术学院：
以化学、生物学、数学等学科为主要发展方向。
南通职业大学：
成立于2003年，是一所以工科为主的应用型本科院校，涵盖工程、商务、艺术等多个领域。
江苏开放大学：
原名江苏广播电视大学，具有本科办学权和学士学位授予权。
清华大学研究生就业实践江苏如东基地：
虽然不是传统意义上的大学，但为清华大学研究生提供实践机会。
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