黑龙江八一农垦大学的专业设置涵盖了农学、工学、管理学、理学、法学、文学、经济学7个学科门类，具体专业如下：
农学院
农学
植物保护
农业资源与环境
环境科学
种子科学与工程
工程学院
农业机械化及其自动化
机械设计制造及其自动化
土木工程
交通运输
工业设计
飞行技术
农业电气化
动物科技学院
动物医学
草业科学
动物科学
动物药学
经济管理学院
农林经济管理
市场营销
国际经济与贸易
物流管理
人力资源管理
会计学
财务管理
审计学
会计学院
会计学
财务管理
审计学
食品学院
食品科学与工程
食品质量与安全
食品营养与检验教育
包装工程
粮食工程
食品营养与健康
电气与信息学院
计算机科学与技术
电气工程及其自动化
农业电气化
通信工程
电子信息工程
人文社会科学学院
政治学与行政学
公共事业管理
英语
社会工作
汉语言文学
生命科学技术学院
生物科学
生物技术
生物工程
制药工程
理学院
信息与计算科学
应用化学
园艺园林学院
园艺
园林
设施农业科学与工程
土木水利学院
土木工程
建筑环境与能源应用工程
水利水电工程
军事体育部
思想政治理论课教学研究部
国家杂粮工程技术研究中心
新农村建设研究院
这些专业中，农业机械化及其自动化、农学、植物保护、动物医学等是国家级特色专业和省级重点专业，具有较高的教学水平和研究实力。建议学生在选择专业时，可以优先考虑这些王牌专业，以获得更好的教育资源和职业发展机会。