长崎大学大学院的专业设置如下：
教育学研究科
教职实践专业（专业学位课程，教职大学院）
教科实践专业（修士课程）
经济学研究科
博士前期课程
博士后期课程
工学研究科
综合工学专业（博士前期课程）
生产系统工程专业（博士后期课程）
绿色系统创建科学专业（5年一贯博士课程）
水产·环境科学综合研究科
水产学专业（博士前期课程）
环境保全设计专业（博士前期课程）
环境共生政策学专攻（博士前期课程）
海洋环境资源学专攻（博士后期课程）
海洋场生命科学专业（5年一贯博士课程）
医齿药学综合研究科
硕士课程：热带医学专业、保健学专业、生命科学专业
博士课程：医疗科学专攻、新兴感染症病情控制学系专业、放射线医学科学专攻
博士后期课程：生命科学专业药
国际健康开发研究科
硕士课程：国际健康开发专业
其他研究科
人类社会学研究科：地域经营管理专攻（博士后期课程）、观光学专攻（硕士课程）、社会福祉学专攻（硕士课程）
健康管理学研究科：健康营养学专攻（硕士课程）
国际信息学研究科：信息媒体学专攻（硕士课程）、国际交流学专攻（硕士课程）
人类健康科学研究科：看护学专攻（硕士课程）、营养科学专攻（硕士课程·博士课程）
这些专业涵盖了教育、经济、工学、环境科学、水产、医学、齿学、药学等多个领域，为学生提供了广泛的研究和学习机会。建议根据个人兴趣和职业规划，选择合适的专业进行深入研究。