佳木斯大学设有多个院系，主要包括但不限于以下：
1. 基础医学院
2. 口腔医学院
3. 药学院
4. 公共卫生学院
5. 护理学院
6. 检验医学院
7. 医学部
8. 材料科学与工程学院
9. 机械工程学院
10. 信息电子技术学院
11. 建筑工程学院
12. 经济与管理学院
13. 外国语学院
14. 人文学院
15. 理学院
16. 体育学院
17. 音乐学院
18. 美术学院
19. 生物与农业学院（原生命科学学院）
20. 教育科学学院
21. 马克思主义学院
22. 研究生部
23. 继续教育学院（实践技能培训中心）
24. 国际教育学院
25. 创新创业学院
此外，佳木斯大学还设有临床医学院、康复医学院（第三附属医院）、旅游管理学院、警官职业学院等二级学院。
请注意，以上信息可能会有所变动，建议以佳木斯大学官方网站或最新公布的信息为准