清末时期，中国创办了许多大学堂，其中一些较为著名的大学包括：
上海交通大学：
其前身是创建于1896年的南洋公学，是中国历史最悠久的高等学府之一。1911年改为南洋大学，1921年改称交通大学，1922年改称交通部南洋大学，1928年又改为交通大学。1957年，交通大学又分为上海和西安两部分。1959年，两处独立建校，称上海交通大学和西安交通大学。
北京大学：
创建于1898年，是中国近代第一所国立大学，初名京师大学堂。
武汉大学：
可以追溯到清朝末期1893年湖广总督张之洞请清政府创办的自强学堂，1913年由国民政府建立国立武昌高等师范学校，于1928年定名为国立武汉大学。
天津大学：
其前身是成立于1895年的北洋大学堂，是中国近代史上的第一所大学。
清华大学：
其前身是成立于1901年的清华学堂。
浙江大学：
其前身可以追溯到1897年创立的求是书院。
京师大学堂：
成立于1898年7月3日，是中国近代第一所国立大学，标志着中国近代国立高等教育的开端。
北洋大学堂：
成立于1895年，是中国近代史上的第一所大学。
广雅书院：
清末四大学府之一，主张“中学为体，西学为用”的教育思想。
两湖书院：
清末四大学府之一，同样主张“中学为体，西学为用”的教育思想。
自强学堂：
清末四大学府之一，也是“中学为体，西学为用”思想的体现。
南洋公学：
清末四大学府之一，是“中学为体，西学为用”思想的体现。
这些大学在清末时期为中国的高等教育奠定了基础，并对中国的现代化进程产生了深远影响。