海南大学排名较低的原因可以归纳为以下几点：
多学科实力不强
海南大学在教育部学科评估中进入B类的学科数量较少，学科门类覆盖不够全面。
地理位置影响
海南大学位于海南省会海口，相比其他省份，海南的经济发展水平和教育资源有限，这影响了学校吸引高分学生及资源的能力。
生源质量
尽管海南大学是211工程院校，但在软科排名中，无论是综合排名还是学生生源指数，都落后于一些双非院校。
办学水准和刻板印象
海南大学的王牌专业主要集中在作物类和水产类，属于区域性大学，在全国范围内的知名度和认可度较低。
海南大学在211大学中的排名相对靠后，且在内地企业招聘和高分考生选择方面存在限制。
海南大学虽然是海南省内最好的大学，也是唯一的211大学，但在更广泛的全国大学排名体系中，其位置确实处于较后的位置。这些因素综合作用，导致了海南大学在全国范围内的排名较低