根据提供的信息，以下是一些开设烟草专业并且与中国烟草局有较好合作关系的大学：
云南农业大学
成立于1907年，是中国最早设立烟草本科专业的高校之一。
烟草学院是国家级特色专业，与烟草行业有深度合作。
河南农业大学
成立于1902年，是一所老牌院校，与国家烟草局有共建关系。
烟草专业是国家级特色专业，并且有博士和硕士的培养体系。
山东农业大学
成立于1906年，烟草专业偏重经济和管理学，培养具备专业技能和经营、管理能力的人才。
安徽农业大学
成立于1928年，农学院的烟草专业全国知名。
郑州轻工业大学
成立于1980年，是国内第一个烟草科学与工程本科专业，有国家级特色专业称号。
青岛农业大学
开设了烟草专业。
湖南农业大学
烟草专业得到烟草行业的认可。
四川农业大学
烟草专业得到烟草行业的认可。
贵州大学
烟草专业得到烟草行业的认可。
西昌学院
烟草专业得到烟草行业的认可。
请注意，以上信息基于发布时间，实际情况可能有所变动，建议以学校最新公布的名单为准。