广州番禺区拥有众多高等教育机构，以下是部分主要大学的列表：
1. 华南理工大学番禺校区
2. 广东工业大学番禺校区
3. 中山大学
4. 华南师范大学
5. 广东外语外贸大学
6. 广州中医药大学
7. 广东药科大学
8. 广州大学
9. 广州美术学院
10. 星海音乐学院
11. 暨南大学
12. 广州医科大学番禺校区
13. 广东文艺职业学院
14. 广州番禺职业技术学院（番禺理工学院）
15. 广东女子职业技术学院
16. 广东金融学院番禺校区
17. 仲恺农业工程学院番禺校区
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