根据提供的信息，以下是云南省高校经费预算排名情况：
云南大学：
以46.89亿元的预算经费位居榜首，是云南省唯一一所“211”兼“双一流”院校，也是云南省综合实力最强的大学。
昆明理工大学：
预算经费为23.86亿元，位列第二。昆明理工大学是一所工科实力较强的院校，拥有国家二级重点学科和国家重点培育学科。
昆明医科大学：
预算经费为13.78亿元，排名第三。昆明医科大学是一所集医疗、科研和教学为一体的高等院校，拥有多家附属医院。
以上排名基于2023年和2024年的数据，云南大学在这两年中均保持领先，显示了其在云南省高校中的重要地位和强大的综合实力