南通大学的强项专业包括：
临床医学- 推荐指数高，是该校的王牌专业之一。
电气工程及其自动化- 推荐指数高，是国家级一流本科专业建设点。
汉语言文学- 推荐指数高，是国家级特色专业建设点。
机械工程及自动化- 推荐指数高，是省级特色专业。
电子信息工程- 推荐指数高，是省级特色专业。
计算机科学与技术- 推荐指数高，是国家级一流本科专业建设点。
预防医学- 推荐指数高，是国家级特色专业建设点。
基础医学- 推荐指数高，是省高校优势学科。
新能源及其装备- 推荐指数高，是省高校优势学科。
信息与通信工程- 推荐指数高，是省一级学科重点学科。
这些专业在学术积淀、研究团队、教学和科研条件等方面都有深厚的底蕴，为学生提供了良好的学习环境和广阔的发展前景。