报考船长可以选择以下大学的相关专业：
大连海事大学：
国内知名的航海类高校，航海技术和轮机工程专业备受认可，与多家航运公司有着紧密的合作关系，学生毕业后就业前景较好。
上海海事大学：
国内一流的航海类高校，航海专业在国内具有很高的声誉，与多家国际知名的航运公司有着紧密的合作，学生毕业后有机会获得良好的职业发展。
集美大学：
国内知名的航海类高校，航海技术和轮机工程专业实力较强，与多家航运公司有着良好的合作关系，学生毕业后就业前景较好。
武汉理工大学：
航海专业在国内也有一定的知名度，与多家航运公司有着紧密的合作关系，学生毕业后就业前景较好。
广东海洋大学：
航海专业实力较强，与多家航运公司有着良好的合作关系，学生毕业后就业前景较好。
中国海洋大学：
海洋科学、海洋工程等专业在国内具有很高的声誉，虽然其航海专业相对较弱，但整体实力仍然较强。
江苏海院：
一些大专类航海学院如江苏海院也可以作为选择。
此外，还有一些其他的航海培训机构也可以提供相关培训和考试，例如青岛船员学院等。
建议根据自己的兴趣、学术成绩和职业规划，选择合适的大学和专业进行报考。同时，需要具备一定的身体条件和相关经验才能顺利通过考试，成为一名合格的船长。