新疆大学的本科专业目录如下：
马克思主义学院
思想政治教育
政治与公共管理学院
政治学与行政学
国际政治
行政管理
劳动与社会保障
社会学
经济与管理学院
经济学
国际经济与贸易
金融学
工商管理
市场营销
物流管理
法学院
法学
中国语言文学学院
汉语言文学
汉语言
中国少数民族语言文学（维吾尔语言）
中国少数民族语言文学（维吾尔语言文学现代文秘）
历史学院
历史学
新闻传播学院
新闻传播学类（广告学、新闻学）
外国语学院
英语
俄语
商学院
国际文化交流
旅游学院
旅游管理类（含旅游管理、酒店管理）
数学与系统科学学院
数学类（含数学与应用数学、信息与计算科学）
统计学
数据科学与大数据技术
物理科学与技术学院
物理学
材料科学与工程
化学学院
化学
化工学院
过程装备与控制工程
高分子材料与工程
化学工程与工艺
能源化学工程
生命科学与技术学院
生物科学
生物工程
食品科学与工程
生态与环境学院
生态学
环境科学
地理与遥感科学学院
地理信息科学
自然地理与资源环境
遥感科学与技术
水文与水资源工程
信息科学与工程学院
计算机科学与技术
信息安全
网络空间安全
通信工程
电子信息工程
机械工程学院
机械类（含机械工程、材料成型及控制工程）
工业工程
机器人工程
交通运输工程学院
交通工程
智能制造现代产业学院
机械工程
电气工程学院
电气工程及其自动化
自动化
能源与动力工程
建筑工程学院
土木工程
测绘工程
工程管理
建筑学