复旦大学与多个国内外大学有合作关系，以下是一些合作实例：
艺术研究院合作
与维也纳大学艺术史系、英国皇家美术学院、爱丁堡大学艺术学院、威尼斯大学艺术史系、奥赛博物馆等海外著名艺术院系和文博机构进行学术合作。
新闻传播人才培养和科研合作
与早稻田大学、巴黎政治大学、香港大学新闻及传媒研究中心等高校就新闻传播人才培养和科研合作交换合作文书。
学生交流项目
与哈佛大学、耶鲁大学、哥伦比亚大学、芝加哥大学、多伦多大学、新加坡国立大学、东京大学、早稻田大学、香港大学、柏林大学、巴黎高科、伦敦政治经济学院等近30个国家和地区的200多所大学签订了学术交流协议。
日韩高等教育合作
与早稻田大学、北海道大学、首尔国立大学、高丽大学和崔钟贤研究院等日韩高等教育机构有合作。
与同济大学合作
签署全面深入战略合作协议，在人才培养、学科建设、科学研究、成果转化等方面开展实质性合作。
与安徽大学合作
签订合作框架协议，在一流学科建设、人才培养、人员交流、科学研究、智库建设等方面开展全方位合作。
世界顶尖科学家论坛合作
牛津大学、复旦大学、上海交通大学在世界顶尖科学家论坛期间宣布成立战略合作意向，将在人才培养、学术交流、科研合作、成果转化等方面优势互补、相互支持。
复旦大学通过与这些机构的合作，旨在促进学术交流、人才培养、科研进步，并加强国际合作网络的建设