河海大学拥有丰富的植物种类，其中包括但不限于以下几种：
绣球花：
绣球花以其秀气、淡雅、嫩绿、素净的外观，在河海大学的校园中开得正好，随风飘落时，如同朵朵白雪在绿叶中闪耀，为校园带来治愈的春色。
珙桐：
珙桐，又称“鸽子树”，是一种珍稀植物，在河海大学的药用植物园中种植，具有很高的药用价值。
园林树种：
河海大学江宁校区拥有100多种园林树种，其中载入南京市古树目录的“一叶荻”是南京市最大的一棵古树。
二月兰：
又称诸葛菜，属于十字花科的草本植物，在河海大学江宁校区盛开，为校园增添了生机与色彩。
学校注重校园绿化工作，制定了日常绿化维护制度和巡查制度，对古树名木进行动态管理，确保校园环境美观宜人。