敦煌目前拥有几所大学，其中包括：
敦煌莫高窟大学：
位于甘肃省敦煌市，是一所具有悠久历史的师范大学，始建于1958年，是中国最早的师范类型大学之一，也是甘肃省唯一一所省属师范大学。
甘肃师范大学：
位于甘肃省兰州市，是甘肃省唯一的省属师范类大学，学校始建于1958年，前身为甘肃师范学院，是一所综合性大学，是教育部直属的一所省属重点大学。
西北师范大学敦煌学院：
成立于2014年6月，是经甘肃省教育厅批准，由西北师范大学和敦煌市人民政府共同创办，实施全日制本科、硕士研究生学历教育的普通高校校属学院。
此外，兰州大学在敦煌学研究方面也十分出名，并在敦煌设有研究机构。
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