日本拥有多所大学提供宗教教育，其中包括基督教、佛教等宗教背景的大学。以下是一些著名的日本宗教大学：
佛教大学
位于京都府，属于净土宗派。
特色为佛教学部，强调念佛修行。
驹泽大学
位于东京，属于禅宗中曹洞宗。
建学理念基于禅宗精神，设有佛教学部。
龙谷大学
位于京都，前身为西本愿寺学寮。
专注于佛教教育，尤其是净土真宗研究。
上智大学
位于东京，由天主教耶稣会创立。
强调外语与国际化教育。
明治学院大学
位于东京，日本首所教会学校。
专注于文科教育，强调“为他人奉献”的校训。
立教大学
位于东京，属于英格兰教会。
是一所圣公会系的基督教私立大学。
国际基督教大学
由长老会创办，位于御殿场市。
是一所国际化的综合性通识教育大学。
这些大学在各自的宗教领域内提供深入的教育和研究，并且很多学校都有与宗教相关的课程和社团活动