位于台湾新竹市的知名大学包括：
台湾交通大学（National Chiao Tung University, NCTU）
成立于1896年，是台湾顶尖的研究型重点大学之一，以理工科著称，尤其在电子、资通讯及光电领域处于世界领先地位。
台湾清华大学（National Taiwan University, NTU）
成立于1911年，是台湾历史最悠久的大学之一，以理工科闻名，并与新竹科学工业园区相邻。
台湾艺术大学（National Taiwan University of Arts, NTUA）
成立于1955年，是台湾地区历史最悠久、学科结构最均衡的艺术高等学府。
中华大学（Chung Hua University, CHU）
成立于1990年，前身为中华工学院，位于新竹市香山区。
玄奘大学
是一所私立大学，前身为玄奘人文社会学院。
元培科技大学
成立于1998年，以工科为主，是台湾重要的科技大学之一。
这些大学构成了新竹市丰富的教育资源，为台湾乃至亚洲的科技发展培养了大批人才