集美区内的本科院校包括：
1. 集美大学
2. 厦门大学
3. 厦门理工学院
4. 华侨大学厦门校区
5. 集美大学诚毅学院
6. 集美大学财经学院
7. 集美大学轮机工程学院
8. 集美大学机械与能源工程学院
9. 集美大学成人教育学院
10. 集美大学教师教育学院
11. 华侨大学华文学院
12. 集美大学航海学院
13. 集美大学水产学院
14. 集美大学食品与生物工程学院
15. 集美大学体育学院
16. 集美大学工商管理学院
17. 集美大学音乐学院
18. 集美大学美术学院
19. 集美大学信息工程学院
20. 集美大学计算机工程学院
21. 集美大学理学院
22. 集美大学外国语学院
23. 集美大学法学院
24. 集美大学文学院
25. 集美大学工程技术学院
26. 集美大学马克思主义学院
27. 集美大学继续教育学院
28. 集美大学海外教育学院
29. 集美大学电影学院
以上信息根据最近更新的数据整理得出，具体专业设置和招生情况请参考各院校的官方信息