清华大学是允许学生转专业的。清华大学提供了多次转专业的机会，具体如下：
新生报到后的二次招生：
新生在报到后，部分院系会举行二次招生，学生可以申请转入特定的班级，如数理基础科学班、化生基础科学班、软件科学实验班以及北京协和医学院临床医学专业。
大一和大二的春季学期：
学生可以在大一年级和大二年级的春季学期提出转专业申请。大一年级末有大约10%的学生能够转专业，而大二年级末有大约5%的学生能够转专业，但大二转系可能需要降级。
本科毕业时的交叉推免研究生：
在本科毕业时，学生还可以通过院系专业交叉推免研究生。
申请机制：
转专业的申请需要经过所在系的同意，并且每个院系有不同的政策和接收标准。一些院系可能会参考学生的学业成绩，有的还需要进行笔试或面试。
成绩要求：
大一大二的平均成绩是一个重要的指标，通常按照学分进行加权平均。转专业的成功率与学生的成绩和排名有关，成绩优异的学生转专业的机会更大。
限制条件：
存在一些限制条件，例如新生入学未满一年者、二年级及以上者、未经委托单位同意的委培生、艺术类或体育类跨文理科类别转专业的学生等不能申请转专业。
综上所述，清华大学确实允许学生转专业，并且提供了多种机会和条件，但学生需要满足相应的成绩要求和院系的具体政策。建议学生在申请转专业时，仔细了解所在院系的具体要求，并提前准备好所有必要的材料。