湖畔大学的课程分为多个模块，主要包括但不限于以下几个部分：
必修课
心力：培养企业家的品格、意志和领导力。
脑力：训练远见、决策和看未来的能力。
体力：包括组织文化人才、技术产品和资本，训练企业家的行动与创新力。
选修课
包括但不限于古诗文吟诵艺术、美学鉴赏（书法、绘画、声乐、器乐等）。
特色课程
如“战略”、“组织变革”、“创业者的征途”、“慧眼禅心”、“硅谷游学”、“DT时代”等。
教学模块
平台经济
打造未来组织
湖畔三板斧
其他课程
科学与技术史
商业与财富
社会与文明
湖畔大学的课程由众多知名企业家和学者授课，旨在培养具有全球视野、未来观和全局观的企业家。