根据提供的信息，东莞改名的高等教育机构包括：
东莞理工学院城市学院更名为东莞城市学院。
东莞市广播电视大学更名为东莞开放大学。
广州南方学院（原中山大学南方学院）更名为广州南方学院。
广州软件学院（原广州大学华软软件学院）更名为广州软件学院。
广州华商学院（原广东财经大学华商学院）更名为广州华商学院。
广州应用科技学院（原广州大学松田学院）更名为广州应用科技学院。
广东工业大学华立学院更名为广州华立学院。
东莞市华南师范大学附属东莞学校更名为东莞市海德实验学校。
东莞市波利亚外国语学校更名为东莞市博立雅外国语学校。
东莞市凤岗东北师大附属益田小学更名为东莞市凤岗益田实验小学。
请注意，上述信息中提及的更名事件发生在不同时间，具体更名日期请参考相关官方公告或新闻报道。如果您需要最新的更名信息，建议直接查询相关院校的官方网站或联系当地的教育部门