南通大学开设的专业十分广泛，涵盖了工、理、文、经、管、法、教育、艺术等多个学科门类。以下是南通大学的一些主要专业：
工学专业
电气工程及其自动化（国家特色专业、国家一流专业建设点等）
自动化（国家一流专业建设点等）
建筑电气与智能化
机器人工程
人工智能
机械工程
机械电子工程
土木工程
水利水电工程
交通工程
交通运输
车辆工程
理学专业
数学与应用数学（师范）
应用统计学
物理学（师范）
光电信息科学与工程
化学工程与工艺
应用化学
环境工程
高分子材料与工程
生物科学（师范）
生物技术
统计学
文学专业
汉语言文学
汉语言文学（师范）
汉语国际教育
秘书学
新闻学
历史学（师范）
英语
英语（师范）
翻译
商务英语
日语
音乐学
音乐表演
美术学（师范）
视觉传达设计
产品设计
工业设计
思想政治教育（师范）
经济与管理学专业
国际经济与贸易
经济与金融
会计学
工商管理
法学
人力资源管理
物流管理
行政管理
信息管理与信息系统
社会工作
法学专业
法学
思想政治教育（师范）
教育学专业
小学教育
学前教育
应用心理学
教育技术学
医学专业
临床医学
口腔医学
医学影像学
生物信息学
康复治疗学
护理学
预防医学
医学检验技术
艺术学专业
美术学
视觉传达设计
产品设计
工业设计
环境设计
动画
建筑学
音乐学
音乐表演
其他专业
体育教育
社会体育指导与管理
药物制剂
自然地理与资源环境
工业设计
口腔医学
纺织工程
交通设备与控制工程
电气工程及其自动化
通信工程
机械电子工程
生物科学（师范）
环境工程
英语（师范）
学前教育
思想政治教育（师范）
物理学（师范）
汉语言文学
旅游管理
电子商务
物联网工程
纳米科技
生物技术
高