中国历史上，许多著名的教会大学在20世纪初由中国基督教或天主教会创办，它们在中国教育近代化过程中起到了重要的作用。以下是一些著名的教会大学：
燕京大学（Yenching University）
创办于1916年，由四所美国及英国基督教教会联合在北京开办。
曾与哈佛大学合作成立哈佛燕京学社，在国内外享有盛誉。
1952年院系调整后，其文科、理科多并入北京大学，工科并入清华大学，法学院、社会学系并入北京政法学院（今中国政法大学）。
圣约翰大学（St. John's University）
成立于1879年，是中国首个全英语授课的大学，有“东方哈佛”和“外交人才养成所”之誉。
1952年院系调整，圣约翰大学被拆散并入复旦大学、华东师范大学和上海第二医学院。
齐鲁大学（Cheeloo University）
正式校名为山东基督教共和大学，由来自美国、英国以及加拿大的14个基督教教会组织联合开办。
鼎盛时号称“华北第一学府”，与燕京大学齐名。
1952年院系调整后，原校址今为山东大学趵突泉校区。
东吴大学（Soochow University）
20世纪初中国第一所民办大学，由基督教监理会在苏州创办。
1951年在台湾复校，成为台湾第一所私立大学。
震旦大学（Aurora University）
由中国神父马相伯于1903年在徐家汇天文台旧址创办。
1952年中国院系调整，震旦大学的院系分别归并给了复旦大学、上海交通大学、同济大学等。
辅仁大学（Fuxing University）
1925年由罗马教廷创办，与北大、清华、燕京并称北平四大名校。
1952年在中国高校调整过程中被撤销，其校舍划入北京师范大学北校区。
岭南大学（Lingnan University）
1888年，格致书院在澳门创办，后更名为岭南学堂，1927年正名为岭南大学。
1952年院系调整后，其学科分别被并入中山大学等高校。
这些教会大学在中国教育史上占有重要地位，它们引进西方教育模式，培养了许多杰出人才，并对中国近现代教育产生了深远影响