北京大学
北京师范大学
福建师范大学
哈尔滨师范大学
首都师范大学
南京艺术学院
清华大学
上海音乐学院
中国传媒大学
中国艺术研究院
中国音乐学院
中央音乐学院
东北师范大学
湖南师范大学
南京师范大学
中央民族大学
山东师范大学
华南师范大学
江西师范大学
陕西师范大学
安徽师范大学
新疆师范大学
西南大学
武汉音乐学院（与武汉理工大学联合培养）。
此外，国外一些知名的音乐博士院校包括：
普罗夫迪夫音乐舞蹈美术学院（保加利亚）。
保加利亚西南大学。
索菲亚国立音乐学院（保加利亚）。
山东大学。
华东师范大学。
伯克利音乐学院（美国）。
美国茱丽亚音乐学院。
德国汉斯·艾斯勒音乐学院。
奥地利维也纳音乐与表演艺术大学。
这些大学在音乐领域享有良好的声誉，并提供了广泛的博士课程。建议根据自己的兴趣和专业方向选择合适的院校进行申请。