日本中外合作办学大学排名如下：
京都大学：
连续3年获得第一名，在智力、学力、独创性方面表现突出。
筑波大学：
行动力排名第一，对人力排名第二，智力、学力排名第三，独创性排名第七。
早稻田大学：
日本顶尖私立大学之一，与中国多所高校有紧密的合作关系。
东京工业大学：
专注于工程技术领域，是日本理工科大学中的佼佼者。
大阪大学：
位于大阪市，是日本关西地区最重要的高等教育机构之一。
明治大学：
位于东京都，是一所历史悠久的私立大学。
以上排名基于最近的信息，具体排名可能会根据不同的评价标准和时间有所变化。