日本大学排名较低的原因可以归纳为以下几点：
研究能力下降：
日本大学的研究能力相较于其他一些国家有所减弱，这可能与资金和财政上的差距有关，特别是在创造研究环境和培养学生方面。
国际化程度不足：
日本大学在国际化方面相对保守，外教和留学生人数较少，这在QS排名中是一个不利因素，因为排名系统重视论文引用数和国际化程度。
论文输出不足：
日本大学偏重职业训练，学术论文产出较少，且多数论文以日语撰写，向国际刊物投稿的频率较低。
教育体系和学术研究环境：
日本的教育体系和学术研究环境可能与其他国家有所不同，这可能影响其在国际排名中的表现。
排名指标局限性：
排名系统可能不完全反映一所大学的实力，特别是对于以日语授课和研究的日本大学来说。
资金和财政差距：
海外大学和日本大学在资金和财政支持上存在差距，且这种差距在逐年扩大。
尽管日本大学在排名中表现不佳，但这并不意味着其教育质量下降。排名只是参考信息，不能完全代表一所大学的实际教学和研究水平。日本大学在诺贝尔奖获得者数量、某些领域的研究前沿地位等方面依然表现卓越