南方的本科大学众多，其中一些著名的大学包括：
江苏
南京大学：简称南大，位于江苏省南京市，是国家双一流、985工程、211工程重点建设高校。
东南大学：简称东大，同样位于南京，是国家双一流、985工程、211工程重点建设高校。
苏州大学
河海大学
中国药科大学
中国矿业大学（徐州）
南京师范大学
南京理工大学
南京航空航天大学
江南大学
南京农业大学
上海
复旦大学：简称“复旦”，位于上海，是国家双一流（A类）、985工程、211工程建设高校。
华东师范大学
上海交通大学
同济大学
浙江
浙江大学：位于杭州，是一所历史悠久、声誉卓著的大学，是国家双一流、985工程、211工程重点建设高校。
广东
中山大学
暨南大学
华南理工大学
华南师范大学
福建
厦门大学：简称厦大，位于厦门，是中国近代教育史上第一所华侨创办的大学，是国内最早招收研究生的大学之一。
四川
四川大学
湖南
中南大学
以上仅为部分南方本科大学的例子，南方地区还有许多其他优秀的大学。