南京医科大学在2024年全国临床医学学科评估中的排名如下：
上海交通大学（A+）
浙江大学（A+）
北京协和医学院（A）
复旦大学（A）
北京大学（A-）
首都医科大学（A-）
华中科技大学（A-）
中南大学（A-）
中山大学（A-）
四川大学（A-）
中国医科大学（B+）
哈尔滨医科大学（B+）
南京医科大学（B+）
山东大学（B+）
重庆医科大学（B+）
海军军医大学（B+）
空军军医大学（B+）
郑州大学（B）
武汉大学（B）
西安交通大学（B）
南方医科大学（B）
天津医科大学（B）
大连医科大学（B）
吉林大学（B）
同济大学（B）
南开大学（B-）
河北医科大学（B）
南京医科大学在全国临床医学学科评估中获得了 B+的成绩，排名第13位。