崇明区目前拥有以下大学：
上海海洋大学崇明学院
上海电机学院崇明学院
上海大学崇明校区
东华大学崇明校区
上海外国语大学崇明校区
上海外国语大学贤达人文经济学院崇明校区
国家开放大学崇明分校
崇明老年大学
上海健康职业技术学院
上海海粟美术设计学院崇明分院
上海市应用科技学校
建议：
上海海洋大学崇明学院和 上海电机学院崇明学院是崇明区较为知名的高校，主要培养海洋相关和电机工程方面的人才。
上海大学崇明校区、 东华大学崇明校区和 上海外国语大学崇明校区等高校在崇明设有校区，提供了丰富的学科选择和教育资源。
上海外国语大学贤达人文经济学院崇明校区是一所全日制本科独立学院，以语言和经济类学科为重点，是一所应用技术型大学。
随着崇明区交通和基础设施的改善，未来可能会有更多的大学进驻崇明，为当地学生提供更多教育机会。