库克大学提供的专业非常广泛，包括但不限于以下几个领域：
自然科学:
生物学
化学
地球与海洋科学
环境科学
生态学
物理
心理学
社会科学:
会计学
经济学
管理学
社会学
政治与国际研究
法律
医学与健康科学:
医学
护理学
兽医学
热带兽医学
公共卫生学
工程与技术:
电子工程与计算机科学
机械与航空航天工程
土木工程
环境工程
矿业工程
人文与语言:
英语
文学与语言学
新闻传播学
视觉与表演艺术
音乐
教育与培训:
教育学
职业疗法
初等教育
特殊教育
商科:
商业管理
市场营销
旅游管理
人力资源管理
研究密集型课程:
热带生物学与保护
热带海洋及环境化学
电子系统与物联网
数据分析
詹姆斯库克大学在热带生物科学、海洋科学和环境科学等领域具有特别的优势，并在全球及澳大利亚的多个学科排名中表现优异。