湖北大学与湖北工业大学
理由：湖北大学是一所省属综合性大学，人文社科类、理学、工学、管理学等专业比较有优势，适合文科生。湖北工业大学则是以工学为特色的多科性大学，工科实力强，但文科也不错，设计学和轻工学全国知名。合并后能够弥补湖北大学在工科方面的不足，形成更为全面的学科优势。
南京医科大学与南京大学
理由：南京医科大学在医学专业门类多，容易出成果，在学科评估中优势明显。南京大学作为国内名校，没有医学院的情况下在“华五”中排名较低。合并后能够增强南京大学在医学领域的实力，提升整体学科水平。
西南政法大学与重庆医科大学
理由：重庆医科大学是由上海医科大学援建的，拥有较强的医学实力。西南政法大学是全国唯一政法类重点大学，具有极高的学术声誉。两校合并后能够打造一所综合性的一流大学，涵盖文、理、工、法等多个学科领域。
安徽医科大学与安徽大学
理由：安徽大学是安徽省属高校中唯一的一所211和双一流院校，文科实力较强。安徽医科大学是省属重点医药类普通本科院校，王牌专业属于重点学科。合并后能够使学科更为齐全，提升安徽大学的整体实力。
湖南的师范类院校
理由：湖南有多所师范类院校，如湖南师范大学、衡阳师范学院等，这些院校在师范教育方面具有同质化倾向。合并这些院校能够优化资源配置，提升教育质量和学术水平。
湖南的医学类院校
理由：湖南有8所纯医学类高等院校，如湖南中医药大学、长沙医学院等。这些院校在医学领域具有较强同质化类别，合并后能够形成更为强大的医学学科集群。
这些建议的合并方案基于学科优势互补、提升综合实力和学术声誉等考虑。当然，具体的合并方案还需要考虑各方面的因素，包括学校的意愿、教育部的审批以及合并后的具体运作等。