哈尔滨工程大学的专业优势主要体现在以下几个方面：
船舶与海洋工程：
该学科在全国排名前列，是学校的传统优势学科。哈尔滨工程大学在船舶与海洋工程领域设计和研究能力出色，曾设计我国第一艘深潜救生艇、第一套潜艇载荷称重系统、第一个军用智能水下机器人等。在教育部第四轮学科评估中，船舶与海洋工程学科位列全国第1，获得A+评级。
核工程与核技术：
该专业是国防七子之一，在国防领域具有明显优势。哈尔滨工程大学在核工程与核技术方面也有很高的水平，拥有国家级科研平台——船舶与海洋工程力学国家级国际联合研究中心。
控制科学与工程：
该学科也是学校的王牌专业之一，在船舶与海洋工程中发挥着重要作用。
自动化：
自动化专业是哈尔滨工程大学的明星专业，在许多赛事上都能看到他们忙碌的身影，如全国大学生“挑战杯”电子设计大赛、国际数学建模竞赛、机器人设计大赛等。
水声工程：
该专业源于1953年中国人民解放军军事工程学院海军工程系声呐专业，是我国水声行业高层次人才的主要培养基地和国家水声技术的重要科研基地。
测控技术与仪器：
该专业是国家品牌专业之一，具有较高水平。
信息对抗技术：
该专业也是国家品牌专业之一，体现了学校在信息技术领域的实力。
机械工程 和 材料科学与工程：
这两个专业是省部重点专业，为学校的工程领域提供了有力支持。
海洋装备与海洋开发：
学校设有海洋机器人专业，涵盖了海洋装备和海洋开发等领域，是本科特色专业之一。
船舶动力：
该专业也是学校的特色专业之一，承担和参与了大多数现役的海军各类水面舰船、常规潜艇、核潜艇、水中兵器等武器装备的研制。
综上所述，哈尔滨工程大学在船舶与海洋工程、核工程与核技术、控制科学与工程、自动化、水声工程、测控技术与仪器、信息对抗技术、机械工程、材料科学与工程、海洋装备与海洋开发、船舶动力等专业方面具有显著优势，这些专业不仅在国内具有较高声誉，还在国际评估中表现优异。建议学生在选择专业时，可以优先考虑这些优势学科。