重庆有以下高校拥有轨道专业：
重庆交通大学：
重庆交通大学是一所以交通运输为主，经、管、理等学科协调发展的重点综合性大学。学校下设11个学院，其中交通运输工程学院和土木与环境工程学院是轨道交通专业的主要学院。该校拥有独立建设、独立招生、独立成活、独立授学位的“轨道交通信号与控制”本科专业，该专业是全国首个以轨道交通工程为定位的“信号与控制”专业，也是轨道交通领域重庆市唯一的人才培养基地。
重庆大学：
重庆大学是一所综合性大学，学校设有交通运输、机械工程、管理科学与工程等学院，其中交通运输工程学院拥有轨道交通运营与控制、轨道交通信号与控制、轨道交通车辆工程等轨道交通专业，该学院是西南及西北地区最早开设交通运输学科的教学院校之一。
西南交通大学：
西南交通大学是中国交通教育和轨道交通行业科研创新领域的高水平综合性研究型大学，学校交通运输学院拥有铁道运输、轨道交通运营与控制、轨道交通车辆工程等轨道交通专业，另外学校还设有轨道交通学研究中心，致力于推动轨道交通领域的教学和科研发展。
重庆工学院：
重庆工学院是一所综合性高职院校，其轨道交通学院是学院的重点建设部门之一。该学院拥有先进的教学设备和实训场地，致力于培养高水平的轨道交通技术技能人才，涵盖了铁道交通运营管理、城市轨道交通机电技术等专业。
重庆工程职业学院轨道交通学院：
重庆工程职业学院是一所综合性高职院校，其轨道交通学院是学院的重点建设部门之一。该学院拥有先进的教学设备和实训场地，致力于培养高水平的轨道交通技术技能人才，涵盖了铁道交通运营管理、城市轨道交通机电技术等专业。
重庆工业职业学院轨道交通分院：
重庆工业职业学院是一所具有较高声誉的职业院校，其轨道交通分院开设了一系列与轨道交通紧密相关的专业。学院注重理论与实践相结合的教学方法，为学生提供良好的实习实训机会，为轨道交通行业输送了大量的优秀人才。
重庆铁路技校：
重庆铁路技校是一所公办的重点学校，学校师资力量雄厚，校企合作，保障就业。
重庆建筑工程职业学院：
重庆建筑工程职业学院有一个轨道交通系。
璧山机电学院：
璧山机电学院的一些专业也可以进入轨道交通领域。
重庆公共运输职业学院：
重庆公共运输职业学院是重庆市人民政府批准设立、国家教育部备案的全日制普通高等职业学院。学院由市属国有重点企业——重庆市城市交通开发投资（集团）有限公司出资举办。学院主校区座落在重庆市江津区双福新区，学院有6个系共27个专业。校内教学实训机构50余个，校外实训基地70余个。轨道交通专业就业情况良好。
重庆铁路运输高级技工学校：
重庆铁路运输高级技工学校是国家级重点职业院校、国家职业训练院试点单位、重庆市高水平中职学校建设单位。学院以服务轨道交通为己任，建有轨道交通专业集群，内设国家职业技能鉴定站、重庆市高技能人才培养基地、重庆轨道交通集团有限公司专业人才培训基地。
这些高校在轨道交通专业方面都有各自的优势和特色，可以根据个人兴趣和职业规划选择合适的学校进行报考。