慕尼黑大学提供多个学科的硕士专业，涵盖了广泛的学术领域。以下是一些主要的专业类别及其包含的专业：
艺术类
艺术史
艺术教育学
音乐教育
音乐学
戏剧学
自然学科类
天体物理学
生物化学
生物信息学
生物学
化学
进化
生态
系统分类
社会系统与可持续性
环境系统与可持续性
地质学
地质材料与地质化学
地球物理学
自然科学与技术史
信息学
数学
媒体信息学
传播学
媒体设计
气象学
神经学
制药学
理论与数学物理学
统计学
生物统计学
经济数学
经济与社会学科类
企业管理学
管理学
人力资源管理
保险学
政治学
法学
社会学
经济学
国民经济学
语言及文化研究类
通用语言学
通用与比较文学
美国文化史
美国文学史
史前东方学
计算机语言学
对外德语
德语语言文学教学法
英语语言文学教学法
历史教学法
英语文学
印度学
跨文化传播
日本学
新闻学
考古学
传播学
逻辑与科学学
教育学
哲学
语音学与语言传播
汉学
特殊教育
宗教学
心理学
商业与教育精英心理学
社会与经济史
语言疗法
语言表达科学
理论语言学
西藏学
亚洲史前考古
医学健康类
流行病学
公共卫生
此外，慕尼黑大学还提供一些精英专业和新兴专业，例如：
高分子材料科学
计算机科学
金融和信息管理学
软件工程
可持续管理与技术
这些专业为学生提供了多样化的选择，涵盖了从艺术到科学，从经济到社会的各个领域。申请者可以根据自己的兴趣和职业规划选择合适的专业。建议申请者在申请前仔细研究每个专业的具体要求，以确保符合入学条件。