南疆地区较为知名的高校排名如下：
新疆大学
新疆大学是新疆维吾尔自治区内排名第一的高校，也是我国211工程和双一流建设高校。它位于首府乌鲁木齐市，拥有优越的地理位置和较大的办学规模，已开设95个本科专业。
石河子大学
石河子大学是新疆维吾尔自治区排名第二的高校，也是一所211工程重点大学，坐落在石河子市。它由新疆生产建设兵团主管，综合实力较强，拥有中国工程院院士两人，并开设了94个本科专业。
新疆农业大学
新疆农业大学是新疆维吾尔自治区排名第三的高校，创办于1952年，由新疆维吾尔自治区主管，入选了中西部高校基础能力建设工程和卓越工程师教育培养计划。
喀什大学
喀什大学在2022年排名第10位。
新疆工程学院
新疆工程学院始建于1958年，位于乌鲁木齐市，设有14个二级学院，开设本科专业34个，2022年在全国大学排名中位列第559位。
新疆理工学院
新疆理工学院坐落于新疆阿克苏市，是由新疆维吾尔自治区人民政府领导和管理的一所应用型本科层次普通高等学校，主要培养区域经济社会发展所需的高素质应用型人才。它在2024年位列南疆地区大学排名第一。
阿克苏职业技术学院
阿克苏职业技术学院是南疆唯一一所自治区示范性高等职业院校，隶属于阿克苏地区行署管理，是一所全日制普通综合高等职业院校。
这些排名综合了不同来源的数据，并考虑了学校的教学质量、学科设置、科研成果和社会影响力等因素。建议学生在选择学校时，可以综合考虑这些排名信息，并结合自身的兴趣和发展方向做出选择。