印尼拥有众多大学，其中一些知名的大学包括：
印度尼西亚大学 （Universitas Indonesia）
印尼排名第一的大学。
在社会科学、自然科学、医学等多个领域具有卓越的学术实力。
茂物农业大学 （IPB University）
农林领域的翘楚。
在农业科学、生物技术、自然资源管理等领域享有国际声誉。
万隆理工学院 （Institut Teknologi Bandung）
工程技术教育与研究中心。
在工程、建筑、信息技术等领域表现卓越。
普瑞玛大学 （Universitas Prima Indonesia, UNPRI）
位于棉兰，是北苏门答腊省最大、最好的私立大学之一。
在医学领域表现突出，在印尼教育部评估中蝉联A级。
印尼总统大学 （Presidential University of Indonesia）
知名的私立研究型大学。
提供多种学科的本科和研究生课程。
诺门森大学 （Nommensen HKBP University）
成立于1954年，是一所非营利综合性大学。
位于印尼第四大城市棉兰。
此外，还有一些以汉语为教学语言或面向当地华人招生的大学，例如塔鲁玛迦大学（又译“达国大学”，印尼语作Universitas...）。
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